Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCPEP1Q9HB40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCPEP1Q9HB40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCPEP1Q9HB40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCPEP1Q9HB40 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCPEP1Q9HB40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCPEP1Q9HB40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCPEP1Q9HB40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCPEP1Q9HB40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCPEP1Q9HB40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCPEP1Q9HB40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCPEP1Q9HB40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCPEP1Q9HB40 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCPEP1Q9HB40 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCPEP1Q9HB40 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCPEP1Q9HB40 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCPEP1Q9HB40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCPEP1Q9HB40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCPEP1Q9HB40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCPEP1Q9HB40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCPEP1Q9HB40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCPEP1Q9HB40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCPEP1Q9HB40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCPEP1Q9HB40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCPEP1Q9HB40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCPEP1Q9HB40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCPEP1Q9HB40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCPEP1Q9HB40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCPEP1Q9HB40 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCPEP1Q9HB40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCPEP1Q9HB40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCPEP1Q9HB40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCPEP1Q9HB40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCPEP1Q9HB40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCPEP1Q9HB40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms