Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7J1

PPP1R3E, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3EQ9H7J1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3EQ9H7J1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3EQ9H7J1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3EQ9H7J1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3EQ9H7J1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3EQ9H7J1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3EQ9H7J1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R3EQ9H7J1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3EQ9H7J1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3EQ9H7J1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R3EQ9H7J1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP1R3EQ9H7J1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3EQ9H7J1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3EQ9H7J1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3EQ9H7J1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3EQ9H7J1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3EQ9H7J1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3EQ9H7J1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R3EQ9H7J1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R3EQ9H7J1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R3EQ9H7J1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3EQ9H7J1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R3EQ9H7J1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R3EQ9H7J1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R3EQ9H7J1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R3EQ9H7J1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R3EQ9H7J1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R3EQ9H7J1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R3EQ9H7J1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R3EQ9H7J1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R3EQ9H7J1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R3EQ9H7J1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R3EQ9H7J1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3EQ9H7J1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3EQ9H7J1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R3EQ9H7J1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3EQ9H7J1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3EQ9H7J1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3EQ9H7J1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3EQ9H7J1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3EQ9H7J1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3EQ9H7J1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3EQ9H7J1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R3EQ9H7J1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3EQ9H7J1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP1R3EQ9H7J1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP1R3EQ9H7J1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3EQ9H7J1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3EQ9H7J1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3EQ9H7J1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3EQ9H7J1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3EQ9H7J1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3EQ9H7J1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R3EQ9H7J1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3EQ9H7J1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3EQ9H7J1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms