Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STN1Q9H668 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STN1Q9H668 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STN1Q9H668 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STN1Q9H668 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STN1Q9H668 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STN1Q9H668 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STN1Q9H668 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
STN1Q9H668 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STN1Q9H668 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STN1Q9H668 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STN1Q9H668 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STN1Q9H668 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STN1Q9H668 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STN1Q9H668 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STN1Q9H668 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STN1Q9H668 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STN1Q9H668 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STN1Q9H668 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STN1Q9H668 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STN1Q9H668 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STN1Q9H668 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STN1Q9H668 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STN1Q9H668 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STN1Q9H668 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STN1Q9H668 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STN1Q9H668 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STN1Q9H668 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STN1Q9H668 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STN1Q9H668 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STN1Q9H668 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STN1Q9H668 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STN1Q9H668 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STN1Q9H668 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STN1Q9H668 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STN1Q9H668 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STN1Q9H668 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STN1Q9H668 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STN1Q9H668 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STN1Q9H668 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms