Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC4Q9H5U6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC4Q9H5U6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC4Q9H5U6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC4Q9H5U6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC4Q9H5U6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC4Q9H5U6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC4Q9H5U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC4Q9H5U6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC4Q9H5U6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC4Q9H5U6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC4Q9H5U6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC4Q9H5U6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC4Q9H5U6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC4Q9H5U6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC4Q9H5U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC4Q9H5U6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC4Q9H5U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC4Q9H5U6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC4Q9H5U6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC4Q9H5U6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC4Q9H5U6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC4Q9H5U6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC4Q9H5U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZCCHC4Q9H5U6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC4Q9H5U6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC4Q9H5U6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC4Q9H5U6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC4Q9H5U6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC4Q9H5U6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC4Q9H5U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC4Q9H5U6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC4Q9H5U6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC4Q9H5U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC4Q9H5U6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC4Q9H5U6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC4Q9H5U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC4Q9H5U6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC4Q9H5U6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC4Q9H5U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC4Q9H5U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC4Q9H5U6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC4Q9H5U6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC4Q9H5U6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms