Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDCL3Q9H2J4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDCL3Q9H2J4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDCL3Q9H2J4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDCL3Q9H2J4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDCL3Q9H2J4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDCL3Q9H2J4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDCL3Q9H2J4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDCL3Q9H2J4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDCL3Q9H2J4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDCL3Q9H2J4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDCL3Q9H2J4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDCL3Q9H2J4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms