Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3Q9H299 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3Q9H299 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3Q9H299 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRL3Q9H299 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRL3Q9H299 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRL3Q9H299 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRL3Q9H299 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRL3Q9H299 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRL3Q9H299 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRL3Q9H299 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRL3Q9H299 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRL3Q9H299 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3Q9H299 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3Q9H299 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3Q9H299 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3Q9H299 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3Q9H299 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3Q9H299 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3Q9H299 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3Q9H299 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3Q9H299 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRL3Q9H299 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRL3Q9H299 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3Q9H299 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3Q9H299 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRL3Q9H299 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRL3Q9H299 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BGRL3Q9H299 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRL3Q9H299 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BGRL3Q9H299 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRL3Q9H299 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BGRL3Q9H299 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRL3Q9H299 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRL3Q9H299 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRL3Q9H299 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms