Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF3Q9H094 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF3Q9H094 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NBPF3Q9H094 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NBPF3Q9H094 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF3Q9H094 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF3Q9H094 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF3Q9H094 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF3Q9H094 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF3Q9H094 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF3Q9H094 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF3Q9H094 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF3Q9H094 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF3Q9H094 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF3Q9H094 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NBPF3Q9H094 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF3Q9H094 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF3Q9H094 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF3Q9H094 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NBPF3Q9H094 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NBPF3Q9H094 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBPF3Q9H094 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NBPF3Q9H094 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NBPF3Q9H094 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NBPF3Q9H094 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBPF3Q9H094 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBPF3Q9H094 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF3Q9H094 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF3Q9H094 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF3Q9H094 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF3Q9H094 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF3Q9H094 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NBPF3Q9H094 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NBPF3Q9H094 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF3Q9H094 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF3Q9H094 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF3Q9H094 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF3Q9H094 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF3Q9H094 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NBPF3Q9H094 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NBPF3Q9H094 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF3Q9H094 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NBPF3Q9H094 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF3Q9H094 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF3Q9H094 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF3Q9H094 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF3Q9H094 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF3Q9H094 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF3Q9H094 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NBPF3Q9H094 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NBPF3Q9H094 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NBPF3Q9H094 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF3Q9H094 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF3Q9H094 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF3Q9H094 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms