Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP1-5Q9BYS1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP1-5Q9BYS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP1-5Q9BYS1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP1-5Q9BYS1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP1-5Q9BYS1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRTAP1-5Q9BYS1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-5Q9BYS1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-5Q9BYS1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms