Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA4Q9BXL8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA4Q9BXL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA4Q9BXL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA4Q9BXL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA4Q9BXL8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA4Q9BXL8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA4Q9BXL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA4Q9BXL8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA4Q9BXL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA4Q9BXL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDCA4Q9BXL8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA4Q9BXL8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA4Q9BXL8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA4Q9BXL8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDCA4Q9BXL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA4Q9BXL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDCA4Q9BXL8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA4Q9BXL8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA4Q9BXL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA4Q9BXL8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA4Q9BXL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDCA4Q9BXL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDCA4Q9BXL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDCA4Q9BXL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA4Q9BXL8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDCA4Q9BXL8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA4Q9BXL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA4Q9BXL8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA4Q9BXL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA4Q9BXL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA4Q9BXL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA4Q9BXL8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA4Q9BXL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA4Q9BXL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA4Q9BXL8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA4Q9BXL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA4Q9BXL8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA4Q9BXL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA4Q9BXL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA4Q9BXL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA4Q9BXL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA4Q9BXL8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA4Q9BXL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA4Q9BXL8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA4Q9BXL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA4Q9BXL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA4Q9BXL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA4Q9BXL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms