Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED18Q9BUE0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED18Q9BUE0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED18Q9BUE0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED18Q9BUE0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED18Q9BUE0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MED18Q9BUE0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MED18Q9BUE0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED18Q9BUE0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED18Q9BUE0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED18Q9BUE0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED18Q9BUE0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED18Q9BUE0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED18Q9BUE0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED18Q9BUE0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED18Q9BUE0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED18Q9BUE0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED18Q9BUE0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED18Q9BUE0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED18Q9BUE0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED18Q9BUE0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED18Q9BUE0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED18Q9BUE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED18Q9BUE0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED18Q9BUE0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED18Q9BUE0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED18Q9BUE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED18Q9BUE0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED18Q9BUE0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED18Q9BUE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms