Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF1Q9BSM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF1Q9BSM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF1Q9BSM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF1Q9BSM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF1Q9BSM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF1Q9BSM1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF1Q9BSM1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF1Q9BSM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF1Q9BSM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF1Q9BSM1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF1Q9BSM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF1Q9BSM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF1Q9BSM1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF1Q9BSM1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF1Q9BSM1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF1Q9BSM1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF1Q9BSM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF1Q9BSM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF1Q9BSM1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF1Q9BSM1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF1Q9BSM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF1Q9BSM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF1Q9BSM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF1Q9BSM1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF1Q9BSM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF1Q9BSM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF1Q9BSM1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF1Q9BSM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF1Q9BSM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF1Q9BSM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF1Q9BSM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF1Q9BSM1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF1Q9BSM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF1Q9BSM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF1Q9BSM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF1Q9BSM1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms