Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM7Q9BQ49 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM7Q9BQ49 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM7Q9BQ49 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM7Q9BQ49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM7Q9BQ49 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM7Q9BQ49 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM7Q9BQ49 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM7Q9BQ49 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM7Q9BQ49 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM7Q9BQ49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM7Q9BQ49 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM7Q9BQ49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM7Q9BQ49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM7Q9BQ49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM7Q9BQ49 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM7Q9BQ49 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM7Q9BQ49 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM7Q9BQ49 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM7Q9BQ49 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM7Q9BQ49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM7Q9BQ49 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM7Q9BQ49 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM7Q9BQ49 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM7Q9BQ49 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM7Q9BQ49 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM7Q9BQ49 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM7Q9BQ49 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM7Q9BQ49 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM7Q9BQ49 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM7Q9BQ49 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM7Q9BQ49 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM7Q9BQ49 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM7Q9BQ49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM7Q9BQ49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM7Q9BQ49 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM7Q9BQ49 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM7Q9BQ49 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM7Q9BQ49 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM7Q9BQ49 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms