Protein–RNA interactions for Protein: Q99884

SLC6A7, Sodium-dependent proline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A7Q99884 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A7Q99884 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A7Q99884 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A7Q99884 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A7Q99884 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A7Q99884 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A7Q99884 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A7Q99884 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A7Q99884 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A7Q99884 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A7Q99884 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A7Q99884 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A7Q99884 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A7Q99884 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A7Q99884 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A7Q99884 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A7Q99884 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A7Q99884 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A7Q99884 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A7Q99884 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A7Q99884 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A7Q99884 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A7Q99884 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A7Q99884 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A7Q99884 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A7Q99884 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A7Q99884 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A7Q99884 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms