Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARD1Q99728 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARD1Q99728 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARD1Q99728 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARD1Q99728 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARD1Q99728 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARD1Q99728 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BARD1Q99728 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARD1Q99728 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARD1Q99728 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARD1Q99728 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARD1Q99728 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BARD1Q99728 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BARD1Q99728 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BARD1Q99728 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARD1Q99728 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARD1Q99728 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARD1Q99728 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARD1Q99728 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARD1Q99728 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARD1Q99728 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARD1Q99728 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARD1Q99728 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARD1Q99728 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARD1Q99728 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BARD1Q99728 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARD1Q99728 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARD1Q99728 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARD1Q99728 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARD1Q99728 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARD1Q99728 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARD1Q99728 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms