Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL2Q96S94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL2Q96S94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL2Q96S94 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNL2Q96S94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL2Q96S94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNL2Q96S94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNL2Q96S94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL2Q96S94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL2Q96S94 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL2Q96S94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL2Q96S94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL2Q96S94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL2Q96S94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNL2Q96S94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL2Q96S94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL2Q96S94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCNL2Q96S94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL2Q96S94 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL2Q96S94 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL2Q96S94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL2Q96S94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL2Q96S94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL2Q96S94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL2Q96S94 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL2Q96S94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL2Q96S94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL2Q96S94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL2Q96S94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL2Q96S94 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCNL2Q96S94 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNL2Q96S94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNL2Q96S94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNL2Q96S94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL2Q96S94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL2Q96S94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL2Q96S94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL2Q96S94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL2Q96S94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL2Q96S94 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNL2Q96S94 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL2Q96S94 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL2Q96S94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL2Q96S94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL2Q96S94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL2Q96S94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL2Q96S94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL2Q96S94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNL2Q96S94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNL2Q96S94 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNL2Q96S94 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL2Q96S94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL2Q96S94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL2Q96S94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL2Q96S94 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL2Q96S94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNL2Q96S94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL2Q96S94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNL2Q96S94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL2Q96S94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL2Q96S94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.5 ms