Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SORCS2Q96PQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SORCS2Q96PQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS2Q96PQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SORCS2Q96PQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS2Q96PQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SORCS2Q96PQ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SORCS2Q96PQ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SORCS2Q96PQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS2Q96PQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS2Q96PQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS2Q96PQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS2Q96PQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS2Q96PQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS2Q96PQ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS2Q96PQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS2Q96PQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS2Q96PQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS2Q96PQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS2Q96PQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS2Q96PQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS2Q96PQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS2Q96PQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS2Q96PQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SORCS2Q96PQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS2Q96PQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS2Q96PQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS2Q96PQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS2Q96PQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS2Q96PQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORCS2Q96PQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS2Q96PQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS2Q96PQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SORCS2Q96PQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS2Q96PQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS2Q96PQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms