Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACRGQ96M98 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACRGQ96M98 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACRGQ96M98 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACRGQ96M98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACRGQ96M98 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACRGQ96M98 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACRGQ96M98 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACRGQ96M98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACRGQ96M98 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACRGQ96M98 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACRGQ96M98 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACRGQ96M98 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACRGQ96M98 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PACRGQ96M98 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PACRGQ96M98 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PACRGQ96M98 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACRGQ96M98 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PACRGQ96M98 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACRGQ96M98 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACRGQ96M98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACRGQ96M98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACRGQ96M98 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACRGQ96M98 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACRGQ96M98 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACRGQ96M98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACRGQ96M98 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACRGQ96M98 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACRGQ96M98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACRGQ96M98 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACRGQ96M98 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PACRGQ96M98 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PACRGQ96M98 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACRGQ96M98 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms