Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW7

CARD19, Caspase recruitment domain-containing protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD19Q96LW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CARD19Q96LW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CARD19Q96LW7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CARD19Q96LW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CARD19Q96LW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CARD19Q96LW7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CARD19Q96LW7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CARD19Q96LW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CARD19Q96LW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CARD19Q96LW7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CARD19Q96LW7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARD19Q96LW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARD19Q96LW7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARD19Q96LW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARD19Q96LW7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CARD19Q96LW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD19Q96LW7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD19Q96LW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD19Q96LW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CARD19Q96LW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CARD19Q96LW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CARD19Q96LW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CARD19Q96LW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CARD19Q96LW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CARD19Q96LW7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CARD19Q96LW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CARD19Q96LW7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms