Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABS1Q96KC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABS1Q96KC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABS1Q96KC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABS1Q96KC9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABS1Q96KC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABS1Q96KC9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABS1Q96KC9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABS1Q96KC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABS1Q96KC9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABS1Q96KC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABS1Q96KC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABS1Q96KC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABS1Q96KC9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABS1Q96KC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABS1Q96KC9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABS1Q96KC9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABS1Q96KC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABS1Q96KC9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABS1Q96KC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CABS1Q96KC9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABS1Q96KC9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABS1Q96KC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABS1Q96KC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABS1Q96KC9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABS1Q96KC9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CABS1Q96KC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABS1Q96KC9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABS1Q96KC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABS1Q96KC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABS1Q96KC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABS1Q96KC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABS1Q96KC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABS1Q96KC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABS1Q96KC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABS1Q96KC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABS1Q96KC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABS1Q96KC9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABS1Q96KC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABS1Q96KC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABS1Q96KC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABS1Q96KC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABS1Q96KC9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABS1Q96KC9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABS1Q96KC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABS1Q96KC9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABS1Q96KC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABS1Q96KC9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABS1Q96KC9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABS1Q96KC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABS1Q96KC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABS1Q96KC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABS1Q96KC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CABS1Q96KC9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABS1Q96KC9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABS1Q96KC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABS1Q96KC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABS1Q96KC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms