Protein–RNA interactions for Protein: Q96I51

RCC1L, RCC1-like G exchanging factor-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1LQ96I51 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCC1LQ96I51 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCC1LQ96I51 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCC1LQ96I51 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCC1LQ96I51 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCC1LQ96I51 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCC1LQ96I51 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCC1LQ96I51 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCC1LQ96I51 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC1LQ96I51 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC1LQ96I51 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCC1LQ96I51 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCC1LQ96I51 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCC1LQ96I51 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC1LQ96I51 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCC1LQ96I51 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCC1LQ96I51 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCC1LQ96I51 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RCC1LQ96I51 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCC1LQ96I51 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCC1LQ96I51 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCC1LQ96I51 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCC1LQ96I51 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCC1LQ96I51 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCC1LQ96I51 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCC1LQ96I51 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCC1LQ96I51 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCC1LQ96I51 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCC1LQ96I51 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCC1LQ96I51 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCC1LQ96I51 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCC1LQ96I51 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCC1LQ96I51 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC1LQ96I51 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCC1LQ96I51 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms