Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF185Q96GF1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF185Q96GF1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF185Q96GF1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF185Q96GF1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF185Q96GF1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF185Q96GF1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF185Q96GF1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF185Q96GF1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF185Q96GF1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF185Q96GF1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF185Q96GF1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNF185Q96GF1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF185Q96GF1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF185Q96GF1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNF185Q96GF1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNF185Q96GF1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RNF185Q96GF1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNF185Q96GF1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF185Q96GF1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNF185Q96GF1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF185Q96GF1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF185Q96GF1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF185Q96GF1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF185Q96GF1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF185Q96GF1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RNF185Q96GF1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNF185Q96GF1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF185Q96GF1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF185Q96GF1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF185Q96GF1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF185Q96GF1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF185Q96GF1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF185Q96GF1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF185Q96GF1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF185Q96GF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF185Q96GF1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF185Q96GF1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF185Q96GF1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF185Q96GF1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF185Q96GF1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms