Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC51Q96ER9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC51Q96ER9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC51Q96ER9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC51Q96ER9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC51Q96ER9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC51Q96ER9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC51Q96ER9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC51Q96ER9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC51Q96ER9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC51Q96ER9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC51Q96ER9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC51Q96ER9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC51Q96ER9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC51Q96ER9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC51Q96ER9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC51Q96ER9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC51Q96ER9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC51Q96ER9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC51Q96ER9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC51Q96ER9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC51Q96ER9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC51Q96ER9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC51Q96ER9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC51Q96ER9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC51Q96ER9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC51Q96ER9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC51Q96ER9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC51Q96ER9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC51Q96ER9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC51Q96ER9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC51Q96ER9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC51Q96ER9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC51Q96ER9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC51Q96ER9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC51Q96ER9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC51Q96ER9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC51Q96ER9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC51Q96ER9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC51Q96ER9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC51Q96ER9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC51Q96ER9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC51Q96ER9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC51Q96ER9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC51Q96ER9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC51Q96ER9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC51Q96ER9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC51Q96ER9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC51Q96ER9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC51Q96ER9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC51Q96ER9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC51Q96ER9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC51Q96ER9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC51Q96ER9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC51Q96ER9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC51Q96ER9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms