Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHISA4Q96DD7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHISA4Q96DD7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHISA4Q96DD7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SHISA4Q96DD7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHISA4Q96DD7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHISA4Q96DD7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHISA4Q96DD7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHISA4Q96DD7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHISA4Q96DD7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHISA4Q96DD7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHISA4Q96DD7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHISA4Q96DD7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SHISA4Q96DD7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SHISA4Q96DD7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHISA4Q96DD7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHISA4Q96DD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHISA4Q96DD7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHISA4Q96DD7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHISA4Q96DD7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHISA4Q96DD7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHISA4Q96DD7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHISA4Q96DD7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHISA4Q96DD7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHISA4Q96DD7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHISA4Q96DD7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHISA4Q96DD7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SHISA4Q96DD7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHISA4Q96DD7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHISA4Q96DD7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHISA4Q96DD7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHISA4Q96DD7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SHISA4Q96DD7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SHISA4Q96DD7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHISA4Q96DD7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SHISA4Q96DD7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHISA4Q96DD7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHISA4Q96DD7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHISA4Q96DD7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SHISA4Q96DD7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SHISA4Q96DD7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHISA4Q96DD7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHISA4Q96DD7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHISA4Q96DD7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHISA4Q96DD7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SHISA4Q96DD7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHISA4Q96DD7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHISA4Q96DD7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHISA4Q96DD7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SHISA4Q96DD7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHISA4Q96DD7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHISA4Q96DD7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHISA4Q96DD7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHISA4Q96DD7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SHISA4Q96DD7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHISA4Q96DD7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHISA4Q96DD7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHISA4Q96DD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHISA4Q96DD7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHISA4Q96DD7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHISA4Q96DD7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHISA4Q96DD7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms