Protein–RNA interactions for Protein: Q96AT9

RPE, Ribulose-phosphate 3-epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEQ96AT9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPEQ96AT9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPEQ96AT9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPEQ96AT9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPEQ96AT9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPEQ96AT9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPEQ96AT9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPEQ96AT9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPEQ96AT9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPEQ96AT9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPEQ96AT9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPEQ96AT9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPEQ96AT9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPEQ96AT9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPEQ96AT9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPEQ96AT9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPEQ96AT9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPEQ96AT9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPEQ96AT9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPEQ96AT9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPEQ96AT9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPEQ96AT9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPEQ96AT9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPEQ96AT9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPEQ96AT9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPEQ96AT9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPEQ96AT9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPEQ96AT9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPEQ96AT9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPEQ96AT9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms