Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBXN4Q92575 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBXN4Q92575 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBXN4Q92575 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBXN4Q92575 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBXN4Q92575 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBXN4Q92575 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBXN4Q92575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBXN4Q92575 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBXN4Q92575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBXN4Q92575 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBXN4Q92575 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBXN4Q92575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBXN4Q92575 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBXN4Q92575 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBXN4Q92575 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBXN4Q92575 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBXN4Q92575 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBXN4Q92575 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
UBXN4Q92575 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBXN4Q92575 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBXN4Q92575 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBXN4Q92575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBXN4Q92575 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBXN4Q92575 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBXN4Q92575 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBXN4Q92575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBXN4Q92575 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBXN4Q92575 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBXN4Q92575 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBXN4Q92575 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBXN4Q92575 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBXN4Q92575 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBXN4Q92575 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN4Q92575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN4Q92575 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBXN4Q92575 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBXN4Q92575 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBXN4Q92575 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBXN4Q92575 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBXN4Q92575 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBXN4Q92575 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBXN4Q92575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBXN4Q92575 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBXN4Q92575 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBXN4Q92575 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBXN4Q92575 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBXN4Q92575 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBXN4Q92575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBXN4Q92575 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBXN4Q92575 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBXN4Q92575 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBXN4Q92575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBXN4Q92575 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBXN4Q92575 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBXN4Q92575 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBXN4Q92575 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBXN4Q92575 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBXN4Q92575 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBXN4Q92575 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBXN4Q92575 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBXN4Q92575 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms