Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3S1Q92572 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3S1Q92572 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3S1Q92572 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3S1Q92572 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3S1Q92572 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3S1Q92572 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3S1Q92572 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3S1Q92572 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3S1Q92572 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3S1Q92572 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3S1Q92572 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3S1Q92572 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3S1Q92572 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3S1Q92572 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3S1Q92572 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3S1Q92572 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3S1Q92572 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3S1Q92572 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3S1Q92572 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3S1Q92572 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3S1Q92572 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3S1Q92572 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3S1Q92572 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3S1Q92572 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3S1Q92572 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3S1Q92572 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3S1Q92572 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3S1Q92572 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3S1Q92572 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3S1Q92572 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3S1Q92572 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3S1Q92572 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3S1Q92572 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3S1Q92572 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3S1Q92572 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3S1Q92572 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3S1Q92572 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3S1Q92572 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3S1Q92572 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3S1Q92572 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3S1Q92572 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3S1Q92572 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3S1Q92572 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms