Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM9SF4Q92544 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM9SF4Q92544 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TM9SF4Q92544 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM9SF4Q92544 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM9SF4Q92544 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM9SF4Q92544 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM9SF4Q92544 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM9SF4Q92544 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM9SF4Q92544 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM9SF4Q92544 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM9SF4Q92544 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM9SF4Q92544 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM9SF4Q92544 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM9SF4Q92544 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM9SF4Q92544 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM9SF4Q92544 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM9SF4Q92544 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TM9SF4Q92544 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM9SF4Q92544 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM9SF4Q92544 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM9SF4Q92544 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM9SF4Q92544 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM9SF4Q92544 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM9SF4Q92544 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM9SF4Q92544 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM9SF4Q92544 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM9SF4Q92544 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM9SF4Q92544 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM9SF4Q92544 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM9SF4Q92544 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM9SF4Q92544 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM9SF4Q92544 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM9SF4Q92544 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM9SF4Q92544 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM9SF4Q92544 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms