Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP35Q8NFH5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP35Q8NFH5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP35Q8NFH5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP35Q8NFH5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP35Q8NFH5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP35Q8NFH5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP35Q8NFH5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP35Q8NFH5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP35Q8NFH5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP35Q8NFH5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP35Q8NFH5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP35Q8NFH5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP35Q8NFH5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP35Q8NFH5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP35Q8NFH5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP35Q8NFH5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP35Q8NFH5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP35Q8NFH5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP35Q8NFH5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP35Q8NFH5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP35Q8NFH5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP35Q8NFH5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP35Q8NFH5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP35Q8NFH5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP35Q8NFH5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP35Q8NFH5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP35Q8NFH5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP35Q8NFH5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP35Q8NFH5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP35Q8NFH5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP35Q8NFH5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP35Q8NFH5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP35Q8NFH5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP35Q8NFH5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP35Q8NFH5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP35Q8NFH5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP35Q8NFH5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP35Q8NFH5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP35Q8NFH5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms