Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIBP2Q8ND30 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIBP2Q8ND30 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP2Q8ND30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP2Q8ND30 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIBP2Q8ND30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIBP2Q8ND30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIBP2Q8ND30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIBP2Q8ND30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIBP2Q8ND30 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIBP2Q8ND30 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIBP2Q8ND30 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIBP2Q8ND30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIBP2Q8ND30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIBP2Q8ND30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIBP2Q8ND30 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIBP2Q8ND30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIBP2Q8ND30 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIBP2Q8ND30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIBP2Q8ND30 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIBP2Q8ND30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIBP2Q8ND30 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP2Q8ND30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIBP2Q8ND30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIBP2Q8ND30 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIBP2Q8ND30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIBP2Q8ND30 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIBP2Q8ND30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP2Q8ND30 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP2Q8ND30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIBP2Q8ND30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIBP2Q8ND30 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIBP2Q8ND30 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIBP2Q8ND30 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIBP2Q8ND30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIBP2Q8ND30 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIBP2Q8ND30 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIBP2Q8ND30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIBP2Q8ND30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms