Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX31Q8N9S9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX31Q8N9S9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX31Q8N9S9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX31Q8N9S9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX31Q8N9S9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX31Q8N9S9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX31Q8N9S9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX31Q8N9S9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX31Q8N9S9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX31Q8N9S9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX31Q8N9S9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX31Q8N9S9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX31Q8N9S9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX31Q8N9S9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX31Q8N9S9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX31Q8N9S9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX31Q8N9S9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX31Q8N9S9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX31Q8N9S9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX31Q8N9S9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX31Q8N9S9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX31Q8N9S9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX31Q8N9S9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX31Q8N9S9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX31Q8N9S9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX31Q8N9S9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX31Q8N9S9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX31Q8N9S9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX31Q8N9S9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX31Q8N9S9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX31Q8N9S9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX31Q8N9S9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX31Q8N9S9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX31Q8N9S9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX31Q8N9S9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX31Q8N9S9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX31Q8N9S9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX31Q8N9S9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX31Q8N9S9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX31Q8N9S9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX31Q8N9S9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX31Q8N9S9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX31Q8N9S9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms