Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHCHD4Q8N4Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHCHD4Q8N4Q1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHCHD4Q8N4Q1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHCHD4Q8N4Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHCHD4Q8N4Q1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms