Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM9

SLC38A6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6Q8IZM9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A6Q8IZM9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A6Q8IZM9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A6Q8IZM9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A6Q8IZM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A6Q8IZM9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A6Q8IZM9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A6Q8IZM9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A6Q8IZM9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A6Q8IZM9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A6Q8IZM9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A6Q8IZM9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A6Q8IZM9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A6Q8IZM9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A6Q8IZM9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A6Q8IZM9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A6Q8IZM9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A6Q8IZM9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A6Q8IZM9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A6Q8IZM9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A6Q8IZM9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A6Q8IZM9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A6Q8IZM9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A6Q8IZM9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A6Q8IZM9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A6Q8IZM9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A6Q8IZM9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A6Q8IZM9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A6Q8IZM9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A6Q8IZM9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A6Q8IZM9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A6Q8IZM9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A6Q8IZM9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A6Q8IZM9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A6Q8IZM9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A6Q8IZM9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A6Q8IZM9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A6Q8IZM9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A6Q8IZM9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A6Q8IZM9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A6Q8IZM9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A6Q8IZM9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A6Q8IZM9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A6Q8IZM9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A6Q8IZM9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A6Q8IZM9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A6Q8IZM9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A6Q8IZM9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A6Q8IZM9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A6Q8IZM9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms