Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEGR1Q7Z3B1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEGR1Q7Z3B1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEGR1Q7Z3B1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEGR1Q7Z3B1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEGR1Q7Z3B1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEGR1Q7Z3B1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEGR1Q7Z3B1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEGR1Q7Z3B1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEGR1Q7Z3B1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEGR1Q7Z3B1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEGR1Q7Z3B1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEGR1Q7Z3B1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NEGR1Q7Z3B1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEGR1Q7Z3B1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEGR1Q7Z3B1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEGR1Q7Z3B1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEGR1Q7Z3B1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEGR1Q7Z3B1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NEGR1Q7Z3B1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEGR1Q7Z3B1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEGR1Q7Z3B1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEGR1Q7Z3B1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEGR1Q7Z3B1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEGR1Q7Z3B1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NEGR1Q7Z3B1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEGR1Q7Z3B1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEGR1Q7Z3B1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEGR1Q7Z3B1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEGR1Q7Z3B1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEGR1Q7Z3B1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEGR1Q7Z3B1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEGR1Q7Z3B1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEGR1Q7Z3B1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms