Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDPD3Q7L5L3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDPD3Q7L5L3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDPD3Q7L5L3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDPD3Q7L5L3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDPD3Q7L5L3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDPD3Q7L5L3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDPD3Q7L5L3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDPD3Q7L5L3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDPD3Q7L5L3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDPD3Q7L5L3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD3Q7L5L3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDPD3Q7L5L3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDPD3Q7L5L3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDPD3Q7L5L3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD3Q7L5L3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDPD3Q7L5L3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD3Q7L5L3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD3Q7L5L3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD3Q7L5L3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD3Q7L5L3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD3Q7L5L3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD3Q7L5L3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD3Q7L5L3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDPD3Q7L5L3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDPD3Q7L5L3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD3Q7L5L3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD3Q7L5L3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD3Q7L5L3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD3Q7L5L3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD3Q7L5L3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDPD3Q7L5L3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDPD3Q7L5L3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDPD3Q7L5L3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDPD3Q7L5L3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDPD3Q7L5L3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDPD3Q7L5L3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDPD3Q7L5L3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDPD3Q7L5L3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDPD3Q7L5L3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDPD3Q7L5L3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDPD3Q7L5L3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD3Q7L5L3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD3Q7L5L3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD3Q7L5L3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD3Q7L5L3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms