Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOUQ7L0Q8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOUQ7L0Q8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOUQ7L0Q8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOUQ7L0Q8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOUQ7L0Q8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOUQ7L0Q8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOUQ7L0Q8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOUQ7L0Q8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOUQ7L0Q8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOUQ7L0Q8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOUQ7L0Q8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOUQ7L0Q8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOUQ7L0Q8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOUQ7L0Q8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOUQ7L0Q8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOUQ7L0Q8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOUQ7L0Q8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOUQ7L0Q8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOUQ7L0Q8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOUQ7L0Q8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOUQ7L0Q8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOUQ7L0Q8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOUQ7L0Q8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOUQ7L0Q8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOUQ7L0Q8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOUQ7L0Q8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms