Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP43Q70EL4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP43Q70EL4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP43Q70EL4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP43Q70EL4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP43Q70EL4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP43Q70EL4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP43Q70EL4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP43Q70EL4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP43Q70EL4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP43Q70EL4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP43Q70EL4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP43Q70EL4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP43Q70EL4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP43Q70EL4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP43Q70EL4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP43Q70EL4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP43Q70EL4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP43Q70EL4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP43Q70EL4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP43Q70EL4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP43Q70EL4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP43Q70EL4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP43Q70EL4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP43Q70EL4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP43Q70EL4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP43Q70EL4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP43Q70EL4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP43Q70EL4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP43Q70EL4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP43Q70EL4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP43Q70EL4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP43Q70EL4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP43Q70EL4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP43Q70EL4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP43Q70EL4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP43Q70EL4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP43Q70EL4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP43Q70EL4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP43Q70EL4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms