Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVX7

NCCRP1, F-box only protein 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCCRP1Q6ZVX7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCCRP1Q6ZVX7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCCRP1Q6ZVX7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCCRP1Q6ZVX7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCCRP1Q6ZVX7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCCRP1Q6ZVX7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCCRP1Q6ZVX7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCCRP1Q6ZVX7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCCRP1Q6ZVX7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCCRP1Q6ZVX7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCCRP1Q6ZVX7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCCRP1Q6ZVX7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCCRP1Q6ZVX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCCRP1Q6ZVX7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCCRP1Q6ZVX7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCCRP1Q6ZVX7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCCRP1Q6ZVX7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCCRP1Q6ZVX7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCCRP1Q6ZVX7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCCRP1Q6ZVX7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NCCRP1Q6ZVX7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCCRP1Q6ZVX7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCCRP1Q6ZVX7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCCRP1Q6ZVX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCCRP1Q6ZVX7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCCRP1Q6ZVX7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCCRP1Q6ZVX7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCCRP1Q6ZVX7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCCRP1Q6ZVX7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NCCRP1Q6ZVX7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCCRP1Q6ZVX7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCCRP1Q6ZVX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCCRP1Q6ZVX7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCCRP1Q6ZVX7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCCRP1Q6ZVX7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCCRP1Q6ZVX7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCCRP1Q6ZVX7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCCRP1Q6ZVX7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCCRP1Q6ZVX7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCCRP1Q6ZVX7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCCRP1Q6ZVX7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCCRP1Q6ZVX7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCCRP1Q6ZVX7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCCRP1Q6ZVX7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCCRP1Q6ZVX7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCCRP1Q6ZVX7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCCRP1Q6ZVX7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCCRP1Q6ZVX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCCRP1Q6ZVX7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCCRP1Q6ZVX7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCCRP1Q6ZVX7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCCRP1Q6ZVX7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCCRP1Q6ZVX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCCRP1Q6ZVX7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCCRP1Q6ZVX7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCCRP1Q6ZVX7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NCCRP1Q6ZVX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCCRP1Q6ZVX7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCCRP1Q6ZVX7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCCRP1Q6ZVX7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCCRP1Q6ZVX7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCCRP1Q6ZVX7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCCRP1Q6ZVX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms