Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SRCAPQ6ZRS2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SRCAPQ6ZRS2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SRCAPQ6ZRS2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SRCAPQ6ZRS2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SRCAPQ6ZRS2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SRCAPQ6ZRS2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SRCAPQ6ZRS2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SRCAPQ6ZRS2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SRCAPQ6ZRS2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
SRCAPQ6ZRS2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SRCAPQ6ZRS2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SRCAPQ6ZRS2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SRCAPQ6ZRS2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SRCAPQ6ZRS2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SRCAPQ6ZRS2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
SRCAPQ6ZRS2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SRCAPQ6ZRS2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SRCAPQ6ZRS2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SRCAPQ6ZRS2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SRCAPQ6ZRS2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SRCAPQ6ZRS2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
SRCAPQ6ZRS2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SRCAPQ6ZRS2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SRCAPQ6ZRS2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SRCAPQ6ZRS2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SRCAPQ6ZRS2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SRCAPQ6ZRS2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SRCAPQ6ZRS2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SRCAPQ6ZRS2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SRCAPQ6ZRS2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SRCAPQ6ZRS2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SRCAPQ6ZRS2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SRCAPQ6ZRS2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SRCAPQ6ZRS2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SRCAPQ6ZRS2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SRCAPQ6ZRS2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SRCAPQ6ZRS2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SRCAPQ6ZRS2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SRCAPQ6ZRS2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SRCAPQ6ZRS2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SRCAPQ6ZRS2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SRCAPQ6ZRS2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SRCAPQ6ZRS2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SRCAPQ6ZRS2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SRCAPQ6ZRS2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SRCAPQ6ZRS2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SRCAPQ6ZRS2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SRCAPQ6ZRS2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SRCAPQ6ZRS2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SRCAPQ6ZRS2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SRCAPQ6ZRS2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SRCAPQ6ZRS2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SRCAPQ6ZRS2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SRCAPQ6ZRS2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SRCAPQ6ZRS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SRCAPQ6ZRS2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SRCAPQ6ZRS2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SRCAPQ6ZRS2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SRCAPQ6ZRS2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SRCAPQ6ZRS2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SRCAPQ6ZRS2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SRCAPQ6ZRS2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SRCAPQ6ZRS2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SRCAPQ6ZRS2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SRCAPQ6ZRS2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SRCAPQ6ZRS2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SRCAPQ6ZRS2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SRCAPQ6ZRS2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
SRCAPQ6ZRS2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms