Protein–RNA interactions for Protein: Q6PP77

XKRX, XK-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKRXQ6PP77 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKRXQ6PP77 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKRXQ6PP77 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
XKRXQ6PP77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XKRXQ6PP77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKRXQ6PP77 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKRXQ6PP77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XKRXQ6PP77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKRXQ6PP77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XKRXQ6PP77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XKRXQ6PP77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XKRXQ6PP77 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XKRXQ6PP77 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XKRXQ6PP77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XKRXQ6PP77 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XKRXQ6PP77 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XKRXQ6PP77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XKRXQ6PP77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XKRXQ6PP77 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XKRXQ6PP77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XKRXQ6PP77 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XKRXQ6PP77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XKRXQ6PP77 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKRXQ6PP77 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XKRXQ6PP77 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKRXQ6PP77 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKRXQ6PP77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XKRXQ6PP77 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKRXQ6PP77 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKRXQ6PP77 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKRXQ6PP77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
XKRXQ6PP77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKRXQ6PP77 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKRXQ6PP77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKRXQ6PP77 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKRXQ6PP77 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKRXQ6PP77 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
XKRXQ6PP77 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKRXQ6PP77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKRXQ6PP77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKRXQ6PP77 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKRXQ6PP77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKRXQ6PP77 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKRXQ6PP77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKRXQ6PP77 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKRXQ6PP77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKRXQ6PP77 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms