Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NSUN3-206ENST00000483378 582 ntTSL 45.48□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 116.6
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PRPF8Q6P2Q9 MDM4-211ENST00000470908 884 ntTSL 511.25□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 116.5
PRPF8Q6P2Q9 MDM4-212ENST00000471783 552 ntTSL 37.72□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 116.5
PRPF8Q6P2Q9 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 116.5
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PRPF8Q6P2Q9 TDG-208ENST00000544060 1139 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.152e-52■■■■■ 98.6
PRPF8Q6P2Q9 PLSCR1-212ENST00000484560 629 ntTSL 5-0.07□□□□□ -2.429e-27■■■■■ 98.6
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PRPF8Q6P2Q9 IST1-214ENST00000538709 491 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-20■■■■■ 98.1
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PRPF8Q6P2Q9 VMP1-212ENST00000591782 729 ntTSL 51.69□□□□□ -2.144e-18■■■■■ 97.3
PRPF8Q6P2Q9 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.725e-11■■■■■ 97.2
PRPF8Q6P2Q9 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.85e-11■■■■■ 97.2
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