Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF343Q6P1L6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF343Q6P1L6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF343Q6P1L6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF343Q6P1L6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF343Q6P1L6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF343Q6P1L6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF343Q6P1L6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF343Q6P1L6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF343Q6P1L6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF343Q6P1L6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF343Q6P1L6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF343Q6P1L6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF343Q6P1L6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF343Q6P1L6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF343Q6P1L6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF343Q6P1L6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF343Q6P1L6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF343Q6P1L6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF343Q6P1L6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF343Q6P1L6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF343Q6P1L6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF343Q6P1L6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF343Q6P1L6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF343Q6P1L6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF343Q6P1L6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF343Q6P1L6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF343Q6P1L6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF343Q6P1L6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF343Q6P1L6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF343Q6P1L6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF343Q6P1L6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF343Q6P1L6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF343Q6P1L6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF343Q6P1L6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF343Q6P1L6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF343Q6P1L6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF343Q6P1L6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF343Q6P1L6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF343Q6P1L6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF343Q6P1L6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms