Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC70Q6NSX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC70Q6NSX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC70Q6NSX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC70Q6NSX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC70Q6NSX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC70Q6NSX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms