Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2LQ5T4T6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2LQ5T4T6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2LQ5T4T6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2LQ5T4T6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2LQ5T4T6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2LQ5T4T6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2LQ5T4T6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2LQ5T4T6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2LQ5T4T6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2LQ5T4T6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2LQ5T4T6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2LQ5T4T6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2LQ5T4T6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2LQ5T4T6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2LQ5T4T6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2LQ5T4T6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2LQ5T4T6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2LQ5T4T6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2LQ5T4T6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2LQ5T4T6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2LQ5T4T6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2LQ5T4T6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2LQ5T4T6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2LQ5T4T6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2LQ5T4T6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2LQ5T4T6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP2LQ5T4T6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2LQ5T4T6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2LQ5T4T6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2LQ5T4T6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2LQ5T4T6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2LQ5T4T6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2LQ5T4T6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2LQ5T4T6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2LQ5T4T6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2LQ5T4T6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP2LQ5T4T6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2LQ5T4T6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP2LQ5T4T6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP2LQ5T4T6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP2LQ5T4T6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2LQ5T4T6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2LQ5T4T6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2LQ5T4T6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2LQ5T4T6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms