Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL5A1-AS1Q5SY13 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL5A1-AS1Q5SY13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL5A1-AS1Q5SY13 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL5A1-AS1Q5SY13 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL5A1-AS1Q5SY13 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL5A1-AS1Q5SY13 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL5A1-AS1Q5SY13 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL5A1-AS1Q5SY13 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL5A1-AS1Q5SY13 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL5A1-AS1Q5SY13 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL5A1-AS1Q5SY13 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL5A1-AS1Q5SY13 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL5A1-AS1Q5SY13 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms