Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNFT1Q5M7Z0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNFT1Q5M7Z0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNFT1Q5M7Z0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNFT1Q5M7Z0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNFT1Q5M7Z0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNFT1Q5M7Z0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNFT1Q5M7Z0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNFT1Q5M7Z0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNFT1Q5M7Z0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNFT1Q5M7Z0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNFT1Q5M7Z0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNFT1Q5M7Z0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNFT1Q5M7Z0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNFT1Q5M7Z0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNFT1Q5M7Z0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNFT1Q5M7Z0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNFT1Q5M7Z0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNFT1Q5M7Z0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNFT1Q5M7Z0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNFT1Q5M7Z0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNFT1Q5M7Z0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNFT1Q5M7Z0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNFT1Q5M7Z0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNFT1Q5M7Z0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNFT1Q5M7Z0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNFT1Q5M7Z0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNFT1Q5M7Z0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNFT1Q5M7Z0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNFT1Q5M7Z0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNFT1Q5M7Z0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNFT1Q5M7Z0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNFT1Q5M7Z0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNFT1Q5M7Z0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNFT1Q5M7Z0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNFT1Q5M7Z0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNFT1Q5M7Z0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNFT1Q5M7Z0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNFT1Q5M7Z0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNFT1Q5M7Z0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNFT1Q5M7Z0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNFT1Q5M7Z0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNFT1Q5M7Z0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RNFT1Q5M7Z0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNFT1Q5M7Z0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNFT1Q5M7Z0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNFT1Q5M7Z0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNFT1Q5M7Z0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNFT1Q5M7Z0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNFT1Q5M7Z0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNFT1Q5M7Z0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNFT1Q5M7Z0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms