Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COLEC12Q5KU26 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COLEC12Q5KU26 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COLEC12Q5KU26 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLEC12Q5KU26 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLEC12Q5KU26 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLEC12Q5KU26 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COLEC12Q5KU26 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLEC12Q5KU26 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLEC12Q5KU26 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COLEC12Q5KU26 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COLEC12Q5KU26 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLEC12Q5KU26 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLEC12Q5KU26 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COLEC12Q5KU26 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COLEC12Q5KU26 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLEC12Q5KU26 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLEC12Q5KU26 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COLEC12Q5KU26 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLEC12Q5KU26 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLEC12Q5KU26 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLEC12Q5KU26 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLEC12Q5KU26 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLEC12Q5KU26 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COLEC12Q5KU26 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COLEC12Q5KU26 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COLEC12Q5KU26 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COLEC12Q5KU26 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COLEC12Q5KU26 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COLEC12Q5KU26 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COLEC12Q5KU26 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLEC12Q5KU26 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COLEC12Q5KU26 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLEC12Q5KU26 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COLEC12Q5KU26 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COLEC12Q5KU26 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COLEC12Q5KU26 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COLEC12Q5KU26 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COLEC12Q5KU26 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COLEC12Q5KU26 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COLEC12Q5KU26 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COLEC12Q5KU26 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLEC12Q5KU26 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COLEC12Q5KU26 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms