Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CMPK2Q5EBM0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CMPK2Q5EBM0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMPK2Q5EBM0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMPK2Q5EBM0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMPK2Q5EBM0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CMPK2Q5EBM0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CMPK2Q5EBM0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CMPK2Q5EBM0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMPK2Q5EBM0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CMPK2Q5EBM0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMPK2Q5EBM0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMPK2Q5EBM0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMPK2Q5EBM0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMPK2Q5EBM0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMPK2Q5EBM0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMPK2Q5EBM0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMPK2Q5EBM0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMPK2Q5EBM0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMPK2Q5EBM0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMPK2Q5EBM0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMPK2Q5EBM0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CMPK2Q5EBM0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMPK2Q5EBM0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMPK2Q5EBM0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CMPK2Q5EBM0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMPK2Q5EBM0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMPK2Q5EBM0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMPK2Q5EBM0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMPK2Q5EBM0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CMPK2Q5EBM0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CMPK2Q5EBM0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMPK2Q5EBM0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMPK2Q5EBM0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CMPK2Q5EBM0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMPK2Q5EBM0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMPK2Q5EBM0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMPK2Q5EBM0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CMPK2Q5EBM0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CMPK2Q5EBM0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CMPK2Q5EBM0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CMPK2Q5EBM0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CMPK2Q5EBM0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CMPK2Q5EBM0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CMPK2Q5EBM0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CMPK2Q5EBM0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CMPK2Q5EBM0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CMPK2Q5EBM0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CMPK2Q5EBM0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CMPK2Q5EBM0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CMPK2Q5EBM0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CMPK2Q5EBM0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CMPK2Q5EBM0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CMPK2Q5EBM0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CMPK2Q5EBM0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CMPK2Q5EBM0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CMPK2Q5EBM0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CMPK2Q5EBM0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CMPK2Q5EBM0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CMPK2Q5EBM0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CMPK2Q5EBM0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms