Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HSP90AB3PQ58FF7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HSP90AB3PQ58FF7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
HSP90AB3PQ58FF7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
HSP90AB3PQ58FF7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
HSP90AB3PQ58FF7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HSP90AB3PQ58FF7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HSP90AB3PQ58FF7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HSP90AB3PQ58FF7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HSP90AB3PQ58FF7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HSP90AB3PQ58FF7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HSP90AB3PQ58FF7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HSP90AB3PQ58FF7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HSP90AB3PQ58FF7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HSP90AB3PQ58FF7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HSP90AB3PQ58FF7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HSP90AB3PQ58FF7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB3PQ58FF7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HSP90AB3PQ58FF7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HSP90AB3PQ58FF7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HSP90AB3PQ58FF7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HSP90AB3PQ58FF7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HSP90AB3PQ58FF7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HSP90AB3PQ58FF7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HSP90AB3PQ58FF7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HSP90AB3PQ58FF7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HSP90AB3PQ58FF7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HSP90AB3PQ58FF7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HSP90AB3PQ58FF7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HSP90AB3PQ58FF7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HSP90AB3PQ58FF7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HSP90AB3PQ58FF7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HSP90AB3PQ58FF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
HSP90AB3PQ58FF7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HSP90AB3PQ58FF7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HSP90AB3PQ58FF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB3PQ58FF7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
HSP90AB3PQ58FF7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HSP90AB3PQ58FF7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HSP90AB3PQ58FF7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HSP90AB3PQ58FF7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HSP90AB3PQ58FF7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HSP90AB3PQ58FF7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HSP90AB3PQ58FF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HSP90AB3PQ58FF7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HSP90AB3PQ58FF7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
HSP90AB3PQ58FF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HSP90AB3PQ58FF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HSP90AB3PQ58FF7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HSP90AB3PQ58FF7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HSP90AB3PQ58FF7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HSP90AB3PQ58FF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HSP90AB3PQ58FF7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
HSP90AB3PQ58FF7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HSP90AB3PQ58FF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSP90AB3PQ58FF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSP90AB3PQ58FF7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
HSP90AB3PQ58FF7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
HSP90AB3PQ58FF7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HSP90AB3PQ58FF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HSP90AB3PQ58FF7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HSP90AB3PQ58FF7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
HSP90AB3PQ58FF7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HSP90AB3PQ58FF7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HSP90AB3PQ58FF7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HSP90AB3PQ58FF7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSP90AB3PQ58FF7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSP90AB3PQ58FF7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HSP90AB3PQ58FF7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
HSP90AB3PQ58FF7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HSP90AB3PQ58FF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HSP90AB3PQ58FF7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HSP90AB3PQ58FF7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HSP90AB3PQ58FF7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB3PQ58FF7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB3PQ58FF7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB3PQ58FF7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HSP90AB3PQ58FF7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HSP90AB3PQ58FF7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HSP90AB3PQ58FF7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HSP90AB3PQ58FF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
HSP90AB3PQ58FF7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HSP90AB3PQ58FF7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HSP90AB3PQ58FF7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HSP90AB3PQ58FF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HSP90AB3PQ58FF7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HSP90AB3PQ58FF7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HSP90AB3PQ58FF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HSP90AB3PQ58FF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms