Protein–RNA interactions for Protein: Q53H96

PYCR3, Pyrroline-5-carboxylate reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYCR3Q53H96 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYCR3Q53H96 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYCR3Q53H96 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PYCR3Q53H96 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PYCR3Q53H96 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PYCR3Q53H96 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PYCR3Q53H96 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PYCR3Q53H96 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYCR3Q53H96 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PYCR3Q53H96 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PYCR3Q53H96 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PYCR3Q53H96 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PYCR3Q53H96 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PYCR3Q53H96 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PYCR3Q53H96 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PYCR3Q53H96 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYCR3Q53H96 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYCR3Q53H96 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PYCR3Q53H96 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYCR3Q53H96 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYCR3Q53H96 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PYCR3Q53H96 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PYCR3Q53H96 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PYCR3Q53H96 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PYCR3Q53H96 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PYCR3Q53H96 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PYCR3Q53H96 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PYCR3Q53H96 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PYCR3Q53H96 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYCR3Q53H96 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYCR3Q53H96 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PYCR3Q53H96 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYCR3Q53H96 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYCR3Q53H96 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PYCR3Q53H96 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PYCR3Q53H96 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PYCR3Q53H96 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PYCR3Q53H96 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PYCR3Q53H96 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PYCR3Q53H96 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PYCR3Q53H96 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PYCR3Q53H96 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PYCR3Q53H96 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PYCR3Q53H96 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PYCR3Q53H96 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PYCR3Q53H96 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PYCR3Q53H96 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PYCR3Q53H96 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PYCR3Q53H96 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PYCR3Q53H96 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PYCR3Q53H96 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PYCR3Q53H96 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PYCR3Q53H96 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms