Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ARHGAP29Q52LW3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARHGAP29Q52LW3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARHGAP29Q52LW3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGAP29Q52LW3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGAP29Q52LW3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGAP29Q52LW3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGAP29Q52LW3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARHGAP29Q52LW3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARHGAP29Q52LW3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGAP29Q52LW3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGAP29Q52LW3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGAP29Q52LW3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARHGAP29Q52LW3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARHGAP29Q52LW3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARHGAP29Q52LW3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARHGAP29Q52LW3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ARHGAP29Q52LW3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ARHGAP29Q52LW3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARHGAP29Q52LW3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARHGAP29Q52LW3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARHGAP29Q52LW3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARHGAP29Q52LW3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARHGAP29Q52LW3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARHGAP29Q52LW3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARHGAP29Q52LW3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARHGAP29Q52LW3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ARHGAP29Q52LW3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARHGAP29Q52LW3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARHGAP29Q52LW3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ARHGAP29Q52LW3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARHGAP29Q52LW3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARHGAP29Q52LW3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARHGAP29Q52LW3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ARHGAP29Q52LW3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARHGAP29Q52LW3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARHGAP29Q52LW3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARHGAP29Q52LW3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARHGAP29Q52LW3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARHGAP29Q52LW3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARHGAP29Q52LW3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGAP29Q52LW3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGAP29Q52LW3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGAP29Q52LW3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGAP29Q52LW3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGAP29Q52LW3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARHGAP29Q52LW3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARHGAP29Q52LW3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARHGAP29Q52LW3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARHGAP29Q52LW3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARHGAP29Q52LW3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARHGAP29Q52LW3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGAP29Q52LW3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARHGAP29Q52LW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARHGAP29Q52LW3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARHGAP29Q52LW3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGAP29Q52LW3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGAP29Q52LW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGAP29Q52LW3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGAP29Q52LW3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms